Ozemlje Kanalske doline ima zelo raznoliko rastlinstvo zaradi velike spremenljivosti ekoloških pogojev, zlasti podnebnih in geoloških.
Morfologija določa dodatne spremembe povezane z izpostavljenostjo pobočij, deloma na severu in deloma na jugu, ter nadmorsko višino, od katere je odvisno spreminjanje temperature.
Ob pobočjih na južni strani gore M. Borgo (1268 m), ki se dvigajo nad mestom Trbiž, je prisoten mešani gozd iglavcev in listavcev z bori, smrekami in bukvami.
Posamezne vrste se izmenjujejo in združujejo glede na različne stacionarne pogoje, ki se razlikujejo od vzhoda proti zahodu, pa tudi od doline proti višjim območjem.
Prisotne so številne vrste cvetja: jegliči, ciklame, marjetice in narcise na travnikih v dolini, ciklame, lilije in orhideje v srednjem pasu, do encijanov in planik v najvišjih skalnatih območjih.
Prisotna je bogata raznolikost vrst, značilnih za obmejno okolje Trbiža med Alpami, Dinarskim gorovjem in Balkanom.